从1998年到2010年，是净水器发展史上的第二阶段，其代表为：美的、水平方、沁园、安吉尔、立升、开能等等。

1998年后，卫生部对净水器实行行政审批的市场准入制，没有卫生许可批件，净水器不得生产、不得销售。设立了门槛后把很多小厂挡在门外，净水器产品的档次有所提高，产品质量、服务意识也大大提高，因此净水器得以迅速发展。

1998年起卫生部对净水器的生产和产品质量加强监管，净水器的生产和产品质量才逐渐有所规范。2000年以来，净水器行业迅速复苏，从业人员及生产规模也已大大超过九十年代中期。目前全国净水器生产企业已达四千余家，年销售各式净水器四千多万台。由于产量大，生产成本降低，净水器及其零配件、易消耗品的售价降低型号多机型通用等优点，成为市民买得起、用得起的家庭生活用品。同时，生产企业也加强质量控制，产品质量和使用寿命大大提高，售后服务也日趋完善。已有些企业生产的让净水机器设备取得了政府的认可和用户的信赖，荣获中国产品和著名商标等荣誉。净水器凭借自身的简单、实用、方便等优势已经开始步入中国的千家万户，成为人们解决水污染问题、饮用洁净、新鲜、卫生的健康水的最佳选择！

这时的技术已有所进步，产品品种也多样化并各具特色，如沁园的净水桶（饮水机专用净水器），开能的全屋净水机（KDF+活性炭），立升的不锈钢管道式超滤净水器，凯弗隆、中荷、鼎安、润鑫等的反渗透纯水机，世保康的微渗透净水器等都各树一帜。还有软水机、滤水壶、龙头式净水器、前置过滤器等等，净水产业园中百花齐放。净水器出水不仅可用于饮用，有的还用于洗衣、沐浴（全屋净水机、软水机），产品品种呈现多样化的模式。

这阶段主要营销模式为招商，由生产厂广招经销商，构成经销商体系，现在一般采用市级代理（销量小的为省级代理）制，变早期的由生产厂“单打独斗”销售改为由经销商在全国各地“遍地开花”销售，因此销量和规模迅速发展。